Die Auseinandersetzung mit Entwurf und Planung generell und in historischem Kontext mit historischen Bauformen und Bauweisen im Speziellen begleitet Markus Hafner schon seit dem Studium. Noch vor Abschluss des Studiums beginnt die Mitarbeit bei Jabornegg & Pálffy Architekten, wesentlich im Rahmen von Wettbewerben.

Ein weiterer Schritt folgt als Universitätsassistent auf der TU Wien als Lehrender in der Entwurfsbetreuung.

Die fortgesetzte Arbeit bei Jabornegg & Palffy mündet in der knapp 10jährigen Beschäftigung mit der Generalplanung und Sanierung des österreichischen Parlamentsgebäudes als Projektleiter der Architektur, von den ersten Überlegungen des Wettbewerbs, Vorentwurf, Entwurf, Ausführungsplanung und Ausführungsbegleitung in allen Belangen der Planung bis zur Übergabe.

Die logische Folge war die Gründung des eigenen Architekturbüros